根据《中共重庆市委、重庆市人民政府关于巴南区机构改革方案的通知》（渝委函〔2001〕76号）、《中共重庆市巴南区委、重庆市巴南区人民政府关于区级机构改革方案的实施意见》（巴南委发〔2001〕48号）、《重庆市机构编制委员会关于同意重庆市巴南区区级机构调整的批复》（渝编〔2007〕40号）和《中共重庆市巴南区委、重庆市巴南区人民政府关于区级机构调整的通知》（巴南委发〔2007〕36号）精神，设置重庆市巴南区商业委员会，挂重庆市巴南区对外经济贸易委员会牌子。重庆市巴南区商业委员会是主管全区商贸流通业、餐饮服务业、食品工业、酒类产销行业、外商投资、对外贸易、对外经济技术合作、茧丝绸行业管理的区政府工作部门。